選課日期:113/12/10截止
課程名稱
AI輔助腦科學單細胞定序分析 AI-Assisted Single-cell RNA Sequencing Analysis for Brain Science
(對應總課程名稱:跨域AI 實作微學分課程AXB AI Co-Teaching Program)
授課教師
生命科學院 陳卓逸 助理教授
醫學院 蕭巧婉 博士後研究員
生命科學院 邱暄雅 博班生
課程概述與目標
本課程旨在探索人工智慧(AI)技術如何應用於腦科學單細胞定序研究,特別聚焦於單細胞RNA定序(scRNA-seq)數據的分析與解讀。本課程將結合理論學習和實際操作,除了介紹單細胞定序技術在腦科學中的應用,學生將於課程中同步進行以AI輔助的單細胞定序數據分析實作。
課程日期
12/16(一) & 12/23(一) 10:10-15:10
課程總時數
8小時
上課地點
圖資401電腦教室[YM]
修課人數上限
20人
先修科目或先備能力
▉是,修課學生須具備:Python 或 R 之相關知識或能力
學生自備物品
可自備筆電
作業、考試、評量
出席率30%、期末成果70%
課程大綱
單元主題 | 內容綱要 | 講授 | 示範 | 習作 | 其他 |
腦科學基礎知識 | 介紹腦科學背景知識與相關實驗 | 2hr | – | – | – |
單細胞定序知識 | 介紹單細胞定序原理與基本應用 | 1hr | 1hr | – | – |
實作 | 實際操作並完成一個小專案 | – | 2hr | 2hr | – |
課程進度表
日期 | 課程進度、內容、主題 | |
12/16 | 腦科學主題背景知識I | |
腦科學主題背景知識II | ||
單細胞定序原理與常見AI分析工具介紹 | ||
官方與商用軟體Demo: 以10x Loupe Browser 及 Partek Flow 為例 | ||
12/23 | 實作part 1 – Data QC and Preprocessing | |
實作part 2 – Graph-based clustering & Visualization | ||
實作part 3 – Classify cells using AI | ||
實作part 4 – Other application for scRNA data |
課程教材
Orchestrating Single-Cell Analysis with Bioconductor
Authors: Robert Amezquita [aut], Aaron Lun [aut, cre], Stephanie Hicks [aut], Raphael Gottardo [aut]
Version: 1.0.6
License: CC BY-NC-ND 3.0 US
Copyright: Bioconductor, 2020
Source: https://github.com/Bioconductor/OrchestratingSingleCellAnalysis
微學分課程Q&A
📌 我想修微學分課程,該如何報名/進行選課?
每門課程將於開課前三週至前一週間開放選課,請同學於選課截止日前至ICT選課系統進行報名。
📌 若是學期課加開的微學分課程,我可以修學期課又修微學分嗎?
完全不可。學生不得同一學期選修學期課及微學分,僅能二擇一。微學分若成功認計僅可計於【自由學分】,而非【必修學分】。
補充說明:學期課是學校課務系統上選的3學分課程,微學分則是在ICT系統上報名的課程,兩者的永久課號不同。有的學期課微學分將會分成-1,-2,-3或A,B,C三階段來進行,每完成一階段,需再報名下一階段選課。若是課程內容設計具連貫性,則未修-1或A者,不得選修-2,-3或B,C課程。
📌 我是校外學生,請問可以選課嗎?
校外學生請點擊ICT選課系統頁面右上角【非本校學生申請賬號】,完成註冊後可以進入系統選課。若該課程不開放給校外學生選課,則無法進行報名。
📌 若已經畢業/在職中,可以選課嗎?
校內/校外的【非學生】身份者,請在選課前寄信詢問授課教師是否可以參與課程,獲教師同意後再進行選課報名,修課名額將以【校內在學學生】為優先。
📌 如何得知是否選上了該課程?
請於選課截止的隔日至選課系統查詢選課結果。
📌 我已經選了課程,該如何退選?
① 若選課報名未截止,可直接在ICT選課系統上點擊【取消報名】。
② 若報名已截止至開課日前,請寄信給助理corlyn@nycu.edu.tw 告知退選意願並說明原因。
③ 若開課當日/課程已進行中,請寫信給授課教師,經老師同意後,截圖/轉寄信件內容給助理。
📌 若沒有退選/無故缺席課程會如何?
未依規定辦理課程退選或無故未到課,將取消該同學兩月內之ICT選課權益,即2個月內無法報名選課系統上的任何課程。
📌 若無法出席課程,該如何請假呢?
若學生因故無法出席課程,請於上課前兩日寫信給授課教師說明請假原因(請附上姓名、學號及請假事由)。
📌 我是學士/碩士/博士生,可以報名選修微學分課程嗎?
可以。惟請留意該學分是否認計為畢業學分,將由您的系所決定。為避免學分爭議,請於抵免前詢問系所該門課的學分是否可以認計。研究生修習之微學分不得採計於畢業學分。
📌 修微學分課程需要繳學分費嗎?
無需。
📌 課程會有成績嗎?
微學分的修課方式比照一般課程,必須通過課堂之作業、測驗、討論、實驗或成果發表等教學活動規定,經授課教師認證,該修課結果通過或不通過。
📌 微學分完修證明該如何申請?
請至微學分課程頁面查詢完修證明申請表,並於結課日前提交申請,詳細規定請參閱表單內容。
📌 申請完修證明就表示匯出學分了嗎?
否,兩者是分開的,授課教師提供成績後,由創創工坊核檢學生修課結果,確認同學【通過】課程後,會在2-4週內以電子檔寄出。而學分登錄表,則需到選課系統下載。
📌 修課結果會直接出現在成績單上嗎?
否,請同學必須於畢業當學期統一提出抵免申請。請至ICT選課系統上【匯出學分登錄表】,經系所認計及各單位簽核完成後,該成績才會出現在成績單上。