【113-1微學分課程】AI輔助腦科學單細胞定序分析 AI-Assisted Single-cell RNA Sequencing Analysis for Brain Science

選課日期:113/12/10截止

課程名稱

AI輔助腦科學單細胞定序分析 AI-Assisted Single-cell RNA Sequencing Analysis for Brain Science

(對應總課程名稱:跨域AI 實作微學分課程AXB AI Co-Teaching Program)

授課教師

生命科學院 陳卓逸 助理教授

醫學院 蕭巧婉 博士後研究員

生命科學院 邱暄雅 博班生

課程概述與目標

本課程旨在探索人工智慧(AI)技術如何應用於腦科學單細胞定序研究,特別聚焦於單細胞RNA定序(scRNA-seq)數據的分析與解讀。本課程將結合理論學習和實際操作,除了介紹單細胞定序技術在腦科學中的應用,學生將於課程中同步進行以AI輔助的單細胞定序數據分析實作。

課程日期

12/16(一) & 12/23(一) 10:10-15:10

課程總時數

8小時

上課地點

圖資401電腦教室[YM]

修課人數上限

20人

先修科目或先備能力

▉是,修課學生須具備:Python 或 R 之相關知識或能力

學生自備物品

可自備筆電

作業、考試、評量

出席率30%、期末成果70%

課程大綱

單元主題內容綱要講授示範習作其他
腦科學基礎知識介紹腦科學背景知識與相關實驗2hr
單細胞定序知識介紹單細胞定序原理與基本應用1hr1hr
實作實際操作並完成一個小專案2hr2hr

課程進度表

 日期  課程進度、內容、主題
12/16腦科學主題背景知識I
腦科學主題背景知識II
單細胞定序原理與常見AI分析工具介紹
官方與商用軟體Demo: 以10x Loupe Browser 及 Partek Flow 為例
12/23實作part 1 – Data QC and Preprocessing
實作part 2 – Graph-based clustering & Visualization
實作part 3 – Classify cells using AI
實作part 4 – Other application for scRNA data

課程教材

Orchestrating Single-Cell Analysis with Bioconductor
Authors: Robert Amezquita [aut], Aaron Lun [aut, cre], Stephanie Hicks [aut], Raphael Gottardo [aut]
Version: 1.0.6
License: CC BY-NC-ND 3.0 US
Copyright: Bioconductor, 2020
Source: https://github.com/Bioconductor/OrchestratingSingleCellAnalysis

微學分課程Q&A

📌 我想修微學分課程,該如何報名/進行選課?

每門課程將於開課前三週至前一週間開放選課,請同學於選課截止日前至ICT選課系統進行報名。

📌 若是學期課加開的微學分課程,我可以修學期課又修微學分嗎?

完全不可。學生不得同一學期選修學期課及微學分,僅能二擇一。微學分若成功認計僅可計於【自由學分】,而非【必修學分】。

補充說明:學期課是學校課務系統上選的3學分課程,微學分則是在ICT系統上報名的課程,兩者的永久課號不同。有的學期課微學分將會分成-1,-2,-3或A,B,C三階段來進行,每完成一階段,需再報名下一階段選課。若是課程內容設計具連貫性,則未修-1或A者,不得選修-2,-3或B,C課程。

📌 我是校外學生,請問可以選課嗎?

校外學生請點擊ICT選課系統頁面右上角【非本校學生申請賬號】,完成註冊後可以進入系統選課。若該課程不開放給校外學生選課,則無法進行報名。

📌 若已經畢業/在職中,可以選課嗎?

校內/校外的【非學生】身份者,請在選課前寄信詢問授課教師是否可以參與課程,獲教師同意後再進行選課報名,修課名額將以【校內在學學生】為優先。

📌 如何得知是否選上了該課程?

請於選課截止的隔日至選課系統查詢選課結果。

📌 我已經選了課程,該如何退選?

① 若選課報名未截止,可直接在ICT選課系統上點擊【取消報名】。
② 若報名已截止至開課日前,請寄信給助理corlyn@nycu.edu.tw 告知退選意願並說明原因。
③ 若開課當日/課程已進行中,請寫信給授課教師,經老師同意後,截圖/轉寄信件內容給助理。

📌 若沒有退選/無故缺席課程會如何?

未依規定辦理課程退選或無故未到課,將取消該同學兩月內之ICT選課權益,即2個月內無法報名選課系統上的任何課程。

📌 若無法出席課程,該如何請假呢?

若學生因故無法出席課程,請於上課前兩日寫信給授課教師說明請假原因(請附上姓名、學號及請假事由)。

📌 我是學士/碩士/博士生,可以報名選修微學分課程嗎?

可以。惟請留意該學分是否認計為畢業學分,將由您的系所決定。為避免學分爭議,請於抵免前詢問系所該門課的學分是否可以認計。研究生修習之微學分不得採計於畢業學分。

📌 修微學分課程需要繳學分費嗎?

無需。

📌 課程會有成績嗎?

微學分的修課方式比照一般課程,必須通過課堂之作業、測驗、討論、實驗或成果發表等教學活動規定,經授課教師認證,該修課結果通過或不通過。

📌 微學分完修證明該如何申請?

請至微學分課程頁面查詢完修證明申請表,並於結課日前提交申請,詳細規定請參閱表單內容。

📌 申請完修證明就表示匯出學分了嗎?

否,兩者是分開的,授課教師提供成績後,由創創工坊核檢學生修課結果,確認同學【通過】課程後,會在2-4週內以電子檔寄出。而學分登錄表,則需到選課系統下載。

📌 修課結果會直接出現在成績單上嗎?

否,請同學必須於畢業當學期統一提出抵免申請。請至ICT選課系統上【匯出學分登錄表】,經系所認計及各單位簽核完成後,該成績才會出現在成績單上。

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